水利用電磁流量計產生的誤差的原因常見有以下幾種：
1、管內液體沒有充滿。由于背壓不足或流量傳感器安裝位置不良，致使測試管內液體未能充滿。當管內存在很少量氣體時，則會使測量結果偏離實際值，造成小誤差;當有很多氣體存在時，則會出現測量值不穩定，輸出晃動，此時測量值誤差較大，不能作為正確結果。
2、被測液體中含有固體成分。當出現這種情況時，儀表通常會出現以下問題：液漿噪聲，電機表面沾染污垢，襯里被磨損或被沉積物覆蓋，流通截面積縮小，導電沉積層或絕緣沉積腹桿電極或襯里，水利用電磁流量計若沉積層有導電物質，流量信號很有可能被短路，使儀表出現故障。
3、電極和接地環材質選擇不當。因材質與被測介質不匹配而引發故障的水利用電磁流量計與介質接觸的零部件有電極與接地環，匹配失當除耐腐蝕問題外，主要是電極表面效應。電極能否可靠地檢測流量信號，對流量計的性能至關重要。接地環起到與介質形成電的連接，通過接地線和零電位接通。當與傳感器連接的工藝管道為塑料或內有絕緣涂層的管道時，必須安裝接地環，否則會造成儀表不能正常工作。
4、測試液體中可能存在結晶體。水利用電磁流量計應慎用易結晶化工物料在溫度正常的情況下正常測量，由于輸送流體的導管都有良好的伴熱保溫性，水利用電磁流量計在保溫工作時不會結晶。但是電磁流量傳感器的測量管難以實施伴熱保溫，因此，流體流過測量管時易因降溫而引起內壁結上一層晶體。由于改用其他原理的流量計測量也同樣存在結晶問題，所以在無其他更好方法的情況下，可選用測量管長度非常短的一種“環形”(oring)電磁流量傳感器，并將流量計的上游管道伴熱保溫予以強化。在管道連接方法上，考慮流量傳感器拆裝方便，在一旦結晶時能方便地拆下維護。
5、液體電導率超過允許范圍引發的問題。液體導電率若接近下限值也有可能出現晃動現象。因為制造廠儀表規范(specification)規定的下限值是在各種使用條件較好狀態下可測出的最低值，而實際條件不可能都很理想，于是就多次遇到低度蒸餾水或去離子水，其導電率接近水利用電磁流量計規范規定的下限值5，使用時卻出現輸出晃動。水利用電磁流量計通常認為能穩定測量的導電率下限值要高1～2個數量級。
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